בתשובה לד''ר הושע אבינתן, 29/07/02 18:21
מוטציות 81865
ארז ליבנה • בתשובה לד''ר הושע אבינתן יום ג', 30/7/2002, 13:23
בקשר לנחשים ומוטציות - מה שאמר השוטה החכם.

בקשר לאקדמאים שפירסמו עבודות בכתבי עת יוקרתיים - נו שויין, טיעון לא רציני.
גם תורת הגזע הנאצית היתה פעם מדע מכובד עם סוללות של מכובדים ומאמרים רציניים.

האמנם יש מתילציה (נמוכה) גם בפרוקריוטים?
אשמח לקרוא את המקור לכך.
מה בדיוק בשכיחות 1/16 ו-‏1/60 ? הרצף CG?
האם אתה מודע לכך שהאותיות C ו-G מכתיבות ל-DNA מבנה יציב ועמיד יותר לחום מהאותיות A ו-T ?
יתכן, וזו סתם הנפצה, שחיידקים רבים מתכוננים ליום בו ינחתו במקום חם מאד, בעוד שיצורים אאוקריוטים רבים מצליחים להמנע ממצבים כאלו.
יתכן גם שיציבות זו מוכתבת מהאופן השונה בו ארוז, מוכפל ובנוי הגנום הפרוקריוטי לעומת חברו האאוקריוטי.
CpG הוא מושג הרלוונטי לתחום המתילציה ולא לתחום הקידוד לחומצות אמינו.
התכוונת ודאי לומר כי האותיות CG מקודדות לחומצה האמינית אלנין בלבד, אך גם זה אינו נכון, משום שאתה מניח בטעות כי ה-CG חייבות להיות האותיות הראשונות בקודון (בן השלוש אותיות), ואילו יש ארבע קודונים בהם הרצפון דווקא בסוף, ובהם הקודון מקודד לחומצות האמינו : ארגינינין, גליצין, ציסטאין וסרין.
מהסיבות הללו לא הייתי תולה באלנין תקוות גדולות.
הנפצה - 81887
שוטה הכפר הגלובלי • בתשובה לארז ליבנה יום ג', 30/7/2002, 14:23
אפשר תרגום?
הקרצה, הפלצה 81936
ארז ליבנה • בתשובה לשוטה הכפר הגלובלי יום ג', 30/7/2002, 16:36
גראפס שפלט מוחי הקודח.
אני לא לוקח עליו שום אחריות...
מקודם חשבתי 83325
ד''ר הושע אבינתן • בתשובה לארז ליבנה יום ג', 6/8/2002, 18:03
מקודם חשבתי שמה מפריע לך ברפואה זו גישה פרגמטית חסרת תבונה, אולם ההשוואה האחרונה שעשית (שאינני רוצה לחזור עליה) מעוררות אסוסאיציות של התנהגות לא מוסרית מצד הרופאים באיצטלה אקדמאית. מה באמת מפריע לך ?

לפי Journal of Allergy clin immun 104,262,99
- ב-‏10 עד 30 אחוזים של CpG יש מתילציה בחיידקים. הם לא ציינו מקור.
הרצף CG הוא 1 ל-‏16 בחיידקים, ו1 ל-‏60 בבני אדם או ביונקים, אם הוא מעניק לחומצת הגרעין מבנה יותר יציב היה בזה יתרון ליונקים, לא לחיידקים, כי הרי חום גופם של היונקים גבוה מהסביבה ולא כן החיידקים.

אכן, שתי חומצות אמיניות נוספות יירדו ב-‏50% ועוד שתיים יירדו ב-‏25%, אם לא יהיה CG, אך הן "יפוצו" במידה מסוימת כי ה-G בדרך כלל מתחלף ב-A, שגם הוא מסוגל להשתתף בקידודן. שאר חומצות האמינו ייסבלו פחות, אולם אלנין בכלל לא יקודד בלי CG. לפיכך נראה לי מאוד מעניין אם קיים הבדל בתכולת אלנין ביונקים ובחיידקים.
מקודם חשבתי 83815
ארז ליבנה • בתשובה לד''ר הושע אבינתן יום ה', 8/8/2002, 22:27
הבנת נכון בפעם הראשונה.
אם יש דבר שבו אני בוטח במערכת הרפואית, הרי זה הפן האתי שהוא חמור ובד"כ טוב מאד.
זוהי השמרנות הקבעונית, חסרת המעוף וההולכת על בטוח אליה כיוונתי את חיציי.
אני לא יודע למה נחרדת מ"מדעני" תורת הגזע הנאצית, אותם אנתרופולוגים, פרנולוגים, ביולוגים ובלשנים ראו עצמם כאנשי מדע כפי שאנו תופסים את עצמנו.
שמתי את דברייך בפרופורציה בפרופורציה הראויה להם, בעיניי.
אז מה אם "את הרפואה מוליכים, לטוב או לרע, אקדמאים שפירסמו עבודות מחקר בכתבי עת יוקרתיים"?
אני לא הולך שולל אחר היוקרה, כבוד והדר שמעניקים עוסקים בתחום זה או אחר לעמיתיהם המצטיינים , כשם שאיני מתרשם מפרס קקטוס הזהב שמעניקים אנשי הפרסום לעצמם בחוסר טעם, או לתחרות מיס תבל.

האם אתה משוכנע שאינך מתבלבל עם ה-GC content, קרי, שיעור האותיות GC בגנום?
האינטואיציה שלך לגבי חיידקים וטמפ' אינה נכונה.
חיידקים חיים בלועותים של הרי געת ובפיותיהם של גייזרים.

פסקה אחרונה - לא הבנתי את דברייך.
ומה בכך אם נמצא הבדלים ברמות האלנין בין אאוקריוטים לפרוקריוטים ? (מן הסתם נמצא, ביחד עם עוד אלפי הבדלים אחרים)
מקודם חשבתי 84513
ד''ר הושע אבינתן • בתשובה לארז ליבנה יום ב', 12/8/2002, 20:47
כדי שאלנין יווצר, דרוש שיהיו זוגות של CG כשה-C ראשונה, מה שכמעט ואין ביונקים ללא מתיל, כלומר בצורה פעילה. אם החלבונים של החיידקים שונים במידה ניכרת מהחלבונים שלנו, הרי הדבר יקל במציאת אנטימיקרובים (גם זה כמובן מעניין, מאחר שהדמיון בין החלבונים ביצורי חומצות גרעין שונים לגמרי הוא מדהים).

הייתי מצפה שקבוצות CG יהיו בעיקר בחיידקים שחיים בתנאי חום גבוהים וביונקים.
חזרה לעמוד הראשי המאמר המלא
מערכת האייל הקורא אינה אחראית לתוכן תגובות שנכתבו בידי קוראים
האייל הקורא RSS מאמרים | כתבו למערכת | אודות האתר | טרם התעדכנת | ארכיון | חיפוש | עזרה | תנאי שימוש © כל הזכויות שמורות